• ಫೇಸ್ಬುಕ್
  • ಲಿಂಕ್ಡ್ಇನ್
  • YouTube

ಅಮೇರಿಕನ್ ವಿದ್ವಾಂಸ ಎರಿಕ್ S. ಲ್ಯಾಂಡರ್ 1996 ರಲ್ಲಿ ಮೂರನೇ ತಲೆಮಾರಿನ ಆಣ್ವಿಕ ಮಾರ್ಕರ್ ಆಗಿ ಸಿಂಗಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಸಂ (SNP) ಅನ್ನು ಔಪಚಾರಿಕವಾಗಿ ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಿದ ನಂತರ, SNP ಯನ್ನು ಆರ್ಥಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ​​ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಜೈವಿಕ ಆನುವಂಶಿಕ ಸಂಪರ್ಕ ನಕ್ಷೆ ನಿರ್ಮಾಣ ಮತ್ತು ಮಾನವ ರೋಗಕಾರಕ ಜೀನ್ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್‌ನಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ., ರೋಗದ ಅಪಾಯದ ರೋಗನಿರ್ಣಯ ಮತ್ತು ಭವಿಷ್ಯ, ವೈಯಕ್ತಿಕ ಔಷಧ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್, ಮತ್ತು ಇತರ ಜೈವಿಕ ಮತ್ತು ವೈದ್ಯಕೀಯ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳು.ನಗದು ಬೆಳೆಗಳ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಕ್ಷೇತ್ರದಲ್ಲಿ, SNP ಯ ಪತ್ತೆಯು ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಲಕ್ಷಣಗಳ ಆರಂಭಿಕ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಅರಿತುಕೊಳ್ಳಬಹುದು.ಈ ಆಯ್ಕೆಯು ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಖರತೆಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ರೂಪವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳ ಹಸ್ತಕ್ಷೇಪವನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ತಪ್ಪಿಸಬಹುದು, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಬಹಳವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.ಆದ್ದರಿಂದ, ಮೂಲ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಕ್ಷೇತ್ರದಲ್ಲಿ SNP ದೊಡ್ಡ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ.

ಏಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಸಮ್ (ಸಿಂಗಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಸಮ್, SNP) ಒಂದೇ ಅಥವಾ ವಿಭಿನ್ನ ಜಾತಿಯ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿವೆ ಎಂಬ ವಿದ್ಯಮಾನವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಒಂದೇ ಬೇಸ್‌ನ ಅಳವಡಿಕೆ, ಅಳಿಸುವಿಕೆ, ಪರಿವರ್ತನೆ ಮತ್ತು ವಿಲೋಮ ಎಲ್ಲವೂ ಈ ವ್ಯತ್ಯಾಸಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು.ಹಿಂದೆ, SNP ಯ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನವು ರೂಪಾಂತರದ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಕ್ಕಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿತ್ತು.SNP ಲೊಕಸ್ ಎಂದು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲು ಜನಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿನ ಆಲೀಲ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದರ ಆವರ್ತನವು 1% ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿರುವುದು ಒಂದು ಭಿನ್ನ ಲೋಕಸ್‌ಗೆ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಆಧುನಿಕ ಜೈವಿಕ ಸಿದ್ಧಾಂತಗಳ ವಿಸ್ತರಣೆ ಮತ್ತು ತಂತ್ರಜ್ಞಾನದ ಅನ್ವಯದೊಂದಿಗೆ, ಆಲೀಲ್ ಆವರ್ತನವು ಇನ್ನು ಮುಂದೆ SNP ಯ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನವನ್ನು ಮಿತಿಗೊಳಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಾದ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲ.ನ್ಯಾಷನಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಇನ್ಫರ್ಮೇಷನ್ (NCBI) ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಸಿಂಗಲ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಸಮ್ಸ್ (dbSNP) ಡೇಟಾಬೇಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸಲಾದ ಏಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ಡೇಟಾದ ಪ್ರಕಾರ, ಕಡಿಮೆ-ಆವರ್ತನದ ಅಳವಡಿಕೆ/ಅಳಿಸುವಿಕೆ, ಮೈಕ್ರೋಸ್ಯಾಟಲೈಟ್ ಬದಲಾವಣೆ, ಇತ್ಯಾದಿ.

SNP ಆಣ್ವಿಕ ಲೇಬಲಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಪತ್ತೆ 1

ಮಾನವ ದೇಹದಲ್ಲಿ, SNP ಯ ಆವರ್ತನವು 0.1% ಆಗಿದೆ.ಬೇರೆ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಹೇಳುವುದಾದರೆ, 1000 ಮೂಲ ಜೋಡಿಗಳಿಗೆ ಸರಾಸರಿ ಒಂದು SNP ಸೈಟ್ ಇರುತ್ತದೆ.ಸಂಭವಿಸುವಿಕೆಯ ಆವರ್ತನವು ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿದ್ದರೂ, ಎಲ್ಲಾ SNP ಸೈಟ್‌ಗಳು ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಗುರುತುಗಳಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ.ಇದು ಮುಖ್ಯವಾಗಿ SNP ಸಂಭವಿಸುವ ಸ್ಥಳಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ.

ಸೈದ್ಧಾಂತಿಕವಾಗಿ, SNP ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಎಲ್ಲಿಯಾದರೂ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು.ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುವ SNP ಗಳು ಸಮಾನಾರ್ಥಕ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮತ್ತು ಸಮಾನಾರ್ಥಕವಲ್ಲದ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡಬಹುದು, ಅಂದರೆ, ರೂಪಾಂತರದ ಮೊದಲು ಮತ್ತು ನಂತರ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲವು ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಬದಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ.ಬದಲಾದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯು ಅದರ ಮೂಲ ಕಾರ್ಯವನ್ನು (ಮಿಸ್ಸೆನ್ಸ್ ಮ್ಯುಟೇಶನ್) ಕಳೆದುಕೊಳ್ಳುವಂತೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅನುವಾದ ಸ್ಥಗಿತಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು (ಅಸಂಬದ್ಧ ರೂಪಾಂತರ).ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಮತ್ತು ಇಂಟರ್ಜೆನಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುವ SNP ಗಳು mRNA ಸ್ಪ್ಲಿಸಿಂಗ್, ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ RNA ಅನುಕ್ರಮ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು DNA ಯ ಬಂಧಿಸುವ ದಕ್ಷತೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರಬಹುದು.ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ:

SNP ವಿಧಗಳು:

SNP ಆಣ್ವಿಕ ಲೇಬಲಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಪತ್ತೆ 2

ಹಲವಾರು ಸಾಮಾನ್ಯ SNP ಟೈಪಿಂಗ್ ವಿಧಾನಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಹೋಲಿಕೆ

ವಿಭಿನ್ನ ತತ್ವಗಳ ಪ್ರಕಾರ, ಸಾಮಾನ್ಯ SNP ಪತ್ತೆ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಈ ಕೆಳಗಿನ ವರ್ಗಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆ:

ಪತ್ತೆ ವಿಧಾನಗಳ ವರ್ಗೀಕರಣ ಹೋಲಿಕೆ

SNP ಆಣ್ವಿಕ ಲೇಬಲಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಪತ್ತೆ 3

ಗಮನಿಸಿ: ಕೋಷ್ಟಕದಲ್ಲಿ ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರಸ್ತುತ ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯವಾದ SNP ಪತ್ತೆ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸೈಟ್ ಹೈಬ್ರಿಡೈಸೇಶನ್ (ASH), ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸೈಟ್ ಪ್ರೈಮರ್ ವಿಸ್ತರಣೆ (ASPE), ಸಿಂಗಲ್ ಬೇಸ್ ವಿಸ್ತರಣೆ (SBCE), ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸೈಟ್ ಕತ್ತರಿಸುವುದು (ASC), ಜೀನ್ ಚಿಪ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ, ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ ಇತರ ಪತ್ತೆ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಹೋಲಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ.

ಮೇಲಿನ ಹಲವಾರು ಸಾಮಾನ್ಯ SNP ಪತ್ತೆ ವಿಧಾನಗಳಲ್ಲಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲದ ಶುದ್ಧೀಕರಣದ ವೆಚ್ಚ ಮತ್ತು ಸಮಯವು ಅನಿವಾರ್ಯವಾಗಿದೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, Foregene ನ ನೇರ PCR ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ಸಂಬಂಧಿತ ಕಿಟ್‌ಗಳು ನೇರವಾಗಿ ಪಿಸಿಆರ್ ಅಥವಾ qPCR ವರ್ಧನೆಯನ್ನು ಶುದ್ಧೀಕರಿಸದ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು, ಇದು SNP ಪತ್ತೆಗೆ ಅಭೂತಪೂರ್ವ ಅನುಕೂಲತೆಯನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.

Foregene ನ ನೇರ PCR ಸರಣಿಯ ಉತ್ಪನ್ನಗಳು ಸರಳವಾಗಿ ಮತ್ತು ಸ್ಥೂಲವಾಗಿ ಮಾದರಿ ಶುದ್ಧೀಕರಣ ಹಂತಗಳನ್ನು ಬಿಟ್ಟುಬಿಡುತ್ತವೆ, ಇದು ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್‌ಗಳನ್ನು ತಯಾರಿಸಲು ಬೇಕಾದ ಸಮಯ ಮತ್ತು ವೆಚ್ಚವನ್ನು ಬಹಳವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ Taq ಪಾಲಿಮರೇಸ್ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ವರ್ಧನೆಯ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣ ವರ್ಧನೆಯ ಪರಿಸರದಿಂದ ವಿವಿಧ ಪ್ರತಿರೋಧಕಗಳನ್ನು ಸಹಿಸಿಕೊಳ್ಳಬಲ್ಲದು.ಈ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ-ಇಳುವರಿಯ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಲು ತಾಂತ್ರಿಕ ಗ್ಯಾರಂಟಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ.ವಿವಿಧ ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರಗಳಿಗೆ ಫೋರ್ಜೀನ್ ಡೈರೆಕ್ಟ್ PCR/qPCR ಕಿಟ್‌ಗಳು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ: ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಅಂಗಾಂಶಗಳು (ಇಲಿ ಬಾಲ, ಜೀಬ್ರಾಫಿಶ್, ಇತ್ಯಾದಿ), ಸಸ್ಯ ಎಲೆಗಳು, ಬೀಜಗಳು (ಪಾಲಿಸ್ಯಾಕರೈಡ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಪಾಲಿಫಿನಾಲ್ ಮಾದರಿಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ) ಇತ್ಯಾದಿ.


ಪೋಸ್ಟ್ ಸಮಯ: ಜುಲೈ-23-2021